Маршрутка Чернигов-сумы, и Чернигов-Харьков есть такие. Ну и наоборот соответственно. Есть поезд, раньше прямой был москва-чернигов, сейчас незнаю, но с пересадкой в нежине можно доехать электричками. на сайте можно посмотреть uz.gov.ua . Или до нежина поездом , а там масса автобусов в чернигов едут, автовокзал рядом с вокзалом.
Также каждый день ходит поезд Москва-Чернигов - Киев. Часть вагонов отцепляют в Нежине, они идут в столицу а состав едет на Чернигов. В Чернигове поезд около 5 часов утра